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很多人選研磨儀,第一反應(yīng)是比參數(shù)、看轉(zhuǎn)速,甚至覺(jué)得越貴越好。結(jié)果大幾萬(wàn)砸下去,買回來(lái)一處理自己的樣本,該降解還是降解,出粉照樣不均勻。其實(shí),買前處理研磨設(shè)備的核心根本不是看機(jī)器有多牛,而是看這臺(tái)機(jī)器的物理原理,能不能精準(zhǔn)拿捏你的樣本。脫離了樣本性質(zhì)去談研磨儀選型,都是瞎胡扯。
今天這篇實(shí)驗(yàn)室組織研磨儀的選型攻略,咱們不講虛的,直接拿國(guó)內(nèi)品牌上海凈信旗下的幾款主力機(jī)型來(lái)打個(gè)樣。大家就不用去翻晦澀難懂的說(shuō)明書(shū),直接拿著自己手里的樣本,往下看,對(duì)號(hào)入座。
大批量的動(dòng)植物軟組織(常見(jiàn)代表:小鼠心/肝/脾/肺/腎、水稻葉片、腫瘤組織)
1. 實(shí)驗(yàn)痛點(diǎn): 這種樣本其實(shí)并不難磨,難的是量大。一次要做幾十上百個(gè)樣品,普通研磨儀根本就不能批量處理,而且前后處理時(shí)間差太大,后面的樣本容易降解,實(shí)驗(yàn)結(jié)果的重復(fù)性也較差。
2. 匹配機(jī)型:高通量組織研磨機(jī)(如:上海凈信JXFSTPRP-576Plus)
3. 原理直白講:純靠三維高頻振蕩暴力撞擊。你把加了裂解液和珠子的管子批量卡進(jìn)去,機(jī)器帶著幾十個(gè)管子一起甩動(dòng),幾分鐘就能把樣品完成研磨破碎,且樣品間的差異性小,重復(fù)性高。
4. 上機(jī)效果: 1分鐘搞定上百個(gè)管子,拿出來(lái)全是非常均勻的組織勻漿。主打一個(gè)干活快、批次一致性高。
硬性韌性較大的樣品組織(常見(jiàn)代表:動(dòng)物骨骼、牙齒、毛發(fā)、皮膚、植物根須)
1. 實(shí)驗(yàn)痛點(diǎn): 剪不斷理還亂。常溫下不管你怎么打,出來(lái)的都是大顆粒殘?jiān)呀庖焊九莶贿M(jìn)去。更致命的是,硬核撞擊會(huì)產(chǎn)生高溫,提取RNA必降解。
2. 匹配機(jī)型:全自動(dòng)低溫組織研磨儀(如:液氮冷凍或壓縮機(jī)制冷系列)
3. 原理直白講:深低溫冷脆+硬質(zhì)合金粉碎結(jié)合應(yīng)用,開(kāi)機(jī)先把艙體降到低溫環(huán)境,把硬骨頭凍成玻璃脆,然后再用不銹鋼珠或者碳化鎢珠去研磨。
4. 上機(jī)效果: 原本砸不碎的骨頭,在低溫下幾十秒就變成了微米級(jí)的細(xì)粉。管子摸著冰涼,RNA和活性蛋白死死鎖住,基本零降解。
高風(fēng)險(xiǎn)、帶傳染性的臨床樣本(常見(jiàn)代表:臨床拭子、帶未知病原體的組織、高致病性真菌)
1. 實(shí)驗(yàn)痛點(diǎn): 怕感染!手工研磨或者用普通敞口機(jī),一旦氣溶膠外溢或者管蓋崩開(kāi),整個(gè)實(shí)驗(yàn)室都要遭殃。
2. 匹配機(jī)型:低溫滅活研磨儀(如:JXCL-MJ-L)
3. 原理直白講:全封閉物理/化學(xué)聯(lián)合滅活,這種機(jī)器的適配器比較講究,帶防漏密封圈。上機(jī)前擰死,機(jī)器在研磨的同時(shí)啟動(dòng)特定的滅活程序。
4. 上機(jī)效果: 從放進(jìn)去到拿出來(lái),全程不開(kāi)蓋。拿到手的不僅是打碎的粉末,更是已經(jīng)失去傳染性的安全樣本。P2/P3實(shí)驗(yàn)室、疾控中心的剛需。
成分復(fù)雜的環(huán)境樣本(常見(jiàn)代表:土壤、動(dòng)物糞便、活性污泥)
1. 實(shí)驗(yàn)痛點(diǎn): 你要的不是把土打碎,而是要把附著在土壤顆粒上的那些微小的細(xì)菌/真菌細(xì)胞壁給破開(kāi),提取樣品的DNA。
2. 匹配機(jī)型:多樣品組織研磨機(jī)(配合玻璃珠/石英砂研磨介質(zhì))
3. 原理直白講:微摩擦破壁,不用大鋼珠,而是往管子里小玻璃珠。機(jī)器高頻震動(dòng)時(shí),這些細(xì)沙子一樣的珠子會(huì)把細(xì)菌外殼生生破碎。
4. 上機(jī)效果: 非常適合宏基因組測(cè)序、腸道菌群研究的前處理研磨應(yīng)用。
買實(shí)驗(yàn)室樣品前處理研磨設(shè)備,先認(rèn)清你的樣本開(kāi)始,再去卡機(jī)器的參數(shù)。 軟組織要通量,硬骨頭要低溫,高危樣本要密封滅活。國(guó)內(nèi)像上海凈信這樣的老牌廠家,他們的產(chǎn)品線已經(jīng)分得很細(xì)了,沒(méi)必要去花幾十萬(wàn)買進(jìn)口品牌的溢價(jià)品。如果你還是拿不準(zhǔn)自己的樣本該配什么型號(hào)、用多大的研磨珠,別猜,直接帶上樣本聯(lián)系廠家的工程師選擇樣機(jī)試用,用跑出來(lái)的電泳數(shù)據(jù)做決定!